امام خمینی بر اصول اخلاقی و انسانی در دفاع نظامی نیز تاکید داشتند، ایشان معتقد بودند که حتی در زمان جنگ، رعایت اصول اخلاقی اسلام مانند حفظ جان غیر نظامیان و اجتناب از تخریب بی دلیل ضروری است.
این رویکرد اخلاق مدار در کنار تقویت تجهیزات نظامی، الگویی برای یک دفاع هوشمندانه و انسانی ارائه می دهد. از دیگر اصول مهم در تفکر امام خمینی بازدارندگی فعال بود، ایشان تأکید داشتند یک کشور اسلامی باید چنان نیروی نظامی قدرتمندی داشته باشد که هیچ دشمنی جرئت حمله به آن را نداشته باشد، تقویت نیروهای مسلح و توسعه تجهیزات پیشرفته، نه به عنوان هدفی صرفاً نظامی بلکه به عنوان عاملی برای تأمین صلح و امنیت در کشور و منطقه مورد توجه امام قرار داشت.
در نهایت، تفکر دفاعی امام خمینی (ره) ترکیبی از ایمان، عدالت، استقلال و تقویت توان نظامی بوده ایشان با تاکید بر، ❌۱ – خود کفائی در تولید تجهیزات ❌۲ – نقش مردم در دفاع ❌۳- حفظ اصول اخلاقی الگویی جامع برای مواجهه با تهدیدات ارائه کردند که همچنان به عنوان پایه ای اساسی در سیاست های دفاعی جمهوری اسلامی ایران مورد استفاده قرار می گیرد. این الگو می تواند برای دیگر کشورها و ملت ها نیز الهام بخش باشد.